Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgo2Q7TSY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgo2Q7TSY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgo2Q7TSY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgo2Q7TSY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgo2Q7TSY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sgo2Q7TSY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sgo2Q7TSY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sgo2Q7TSY8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sgo2Q7TSY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sgo2Q7TSY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sgo2Q7TSY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sgo2Q7TSY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sgo2Q7TSY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sgo2Q7TSY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sgo2Q7TSY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sgo2Q7TSY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sgo2Q7TSY8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sgo2Q7TSY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sgo2Q7TSY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sgo2Q7TSY8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sgo2Q7TSY8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sgo2Q7TSY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sgo2Q7TSY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgo2Q7TSY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgo2Q7TSY8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgo2Q7TSY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgo2Q7TSY8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgo2Q7TSY8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sgo2Q7TSY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sgo2Q7TSY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sgo2Q7TSY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sgo2Q7TSY8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgo2Q7TSY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgo2Q7TSY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgo2Q7TSY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sgo2Q7TSY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sgo2Q7TSY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgo2Q7TSY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sgo2Q7TSY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgo2Q7TSY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgo2Q7TSY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgo2Q7TSY8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgo2Q7TSY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgo2Q7TSY8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgo2Q7TSY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms