Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf5Q7TSN7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Igsf5Q7TSN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Igsf5Q7TSN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Igsf5Q7TSN7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Igsf5Q7TSN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Igsf5Q7TSN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Igsf5Q7TSN7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf5Q7TSN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Igsf5Q7TSN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf5Q7TSN7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf5Q7TSN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf5Q7TSN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf5Q7TSN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf5Q7TSN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf5Q7TSN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf5Q7TSN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf5Q7TSN7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Igsf5Q7TSN7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Igsf5Q7TSN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Igsf5Q7TSN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Igsf5Q7TSN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Igsf5Q7TSN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Igsf5Q7TSN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igsf5Q7TSN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Igsf5Q7TSN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igsf5Q7TSN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms