Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmQ7TSN2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmQ7TSN2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmQ7TSN2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmQ7TSN2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmQ7TSN2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmQ7TSN2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmQ7TSN2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmQ7TSN2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ClmQ7TSN2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ClmQ7TSN2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmQ7TSN2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmQ7TSN2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmQ7TSN2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmQ7TSN2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmQ7TSN2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmQ7TSN2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmQ7TSN2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmQ7TSN2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmQ7TSN2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmQ7TSN2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmQ7TSN2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmQ7TSN2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClmQ7TSN2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClmQ7TSN2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClmQ7TSN2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ClmQ7TSN2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClmQ7TSN2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClmQ7TSN2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ClmQ7TSN2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClmQ7TSN2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmQ7TSN2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClmQ7TSN2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmQ7TSN2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmQ7TSN2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms