Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim17Q7TPM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim17Q7TPM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim17Q7TPM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim17Q7TPM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim17Q7TPM3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim17Q7TPM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim17Q7TPM3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim17Q7TPM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim17Q7TPM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim17Q7TPM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim17Q7TPM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim17Q7TPM3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim17Q7TPM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim17Q7TPM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim17Q7TPM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim17Q7TPM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim17Q7TPM3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim17Q7TPM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim17Q7TPM3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim17Q7TPM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim17Q7TPM3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim17Q7TPM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim17Q7TPM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim17Q7TPM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim17Q7TPM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim17Q7TPM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim17Q7TPM3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim17Q7TPM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim17Q7TPM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim17Q7TPM3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim17Q7TPM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim17Q7TPM3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim17Q7TPM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim17Q7TPM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim17Q7TPM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim17Q7TPM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim17Q7TPM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim17Q7TPM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim17Q7TPM3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim17Q7TPM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim17Q7TPM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim17Q7TPM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim17Q7TPM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim17Q7TPM3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim17Q7TPM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Trim17Q7TPM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim17Q7TPM3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim17Q7TPM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim17Q7TPM3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim17Q7TPM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim17Q7TPM3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim17Q7TPM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim17Q7TPM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim17Q7TPM3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim17Q7TPM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim17Q7TPM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms