Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mycbp2Q7TPH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mycbp2Q7TPH6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mycbp2Q7TPH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mycbp2Q7TPH6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mycbp2Q7TPH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mycbp2Q7TPH6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mycbp2Q7TPH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mycbp2Q7TPH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mycbp2Q7TPH6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mycbp2Q7TPH6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mycbp2Q7TPH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mycbp2Q7TPH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mycbp2Q7TPH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mycbp2Q7TPH6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms