Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp397Q7TNK4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zfp397Q7TNK4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp397Q7TNK4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp397Q7TNK4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp397Q7TNK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zfp397Q7TNK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp397Q7TNK4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp397Q7TNK4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp397Q7TNK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp397Q7TNK4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp397Q7TNK4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp397Q7TNK4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp397Q7TNK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp397Q7TNK4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp397Q7TNK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp397Q7TNK4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp397Q7TNK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zfp397Q7TNK4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp397Q7TNK4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp397Q7TNK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp397Q7TNK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp397Q7TNK4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp397Q7TNK4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp397Q7TNK4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp397Q7TNK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp397Q7TNK4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp397Q7TNK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfp397Q7TNK4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp397Q7TNK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp397Q7TNK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zfp397Q7TNK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zfp397Q7TNK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms