Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE6

Duxbl2, Double homeobox B-like, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Duxbl2Q7TNE6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Duxbl2Q7TNE6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duxbl2Q7TNE6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Duxbl2Q7TNE6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Duxbl2Q7TNE6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Duxbl2Q7TNE6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Duxbl2Q7TNE6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Duxbl2Q7TNE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Duxbl2Q7TNE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Duxbl2Q7TNE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Duxbl2Q7TNE6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Duxbl2Q7TNE6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms