Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubb2aQ7TMM9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubb2aQ7TMM9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubb2aQ7TMM9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb2aQ7TMM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tubb2aQ7TMM9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubb2aQ7TMM9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb2aQ7TMM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tubb2aQ7TMM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tubb2aQ7TMM9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tubb2aQ7TMM9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb2aQ7TMM9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubb2aQ7TMM9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tubb2aQ7TMM9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb2aQ7TMM9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb2aQ7TMM9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb2aQ7TMM9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb2aQ7TMM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb2aQ7TMM9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb2aQ7TMM9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tubb2aQ7TMM9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb2aQ7TMM9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb2aQ7TMM9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb2aQ7TMM9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb2aQ7TMM9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb2aQ7TMM9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubb2aQ7TMM9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubb2aQ7TMM9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb2aQ7TMM9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb2aQ7TMM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb2aQ7TMM9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb2aQ7TMM9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb2aQ7TMM9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb2aQ7TMM9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb2aQ7TMM9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubb2aQ7TMM9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb2aQ7TMM9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb2aQ7TMM9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb2aQ7TMM9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb2aQ7TMM9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb2aQ7TMM9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb2aQ7TMM9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms