Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ScocQ78YZ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ScocQ78YZ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScocQ78YZ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScocQ78YZ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ScocQ78YZ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScocQ78YZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScocQ78YZ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScocQ78YZ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScocQ78YZ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScocQ78YZ6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScocQ78YZ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScocQ78YZ6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms