Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snd1Q78PY7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snd1Q78PY7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snd1Q78PY7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snd1Q78PY7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snd1Q78PY7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snd1Q78PY7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snd1Q78PY7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snd1Q78PY7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snd1Q78PY7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snd1Q78PY7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snd1Q78PY7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snd1Q78PY7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snd1Q78PY7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snd1Q78PY7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snd1Q78PY7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snd1Q78PY7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Snd1Q78PY7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snd1Q78PY7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snd1Q78PY7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snd1Q78PY7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snd1Q78PY7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snd1Q78PY7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snd1Q78PY7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snd1Q78PY7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snd1Q78PY7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snd1Q78PY7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Snd1Q78PY7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snd1Q78PY7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snd1Q78PY7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snd1Q78PY7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Snd1Q78PY7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms