Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Igsf3Q6ZQA6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Igsf3Q6ZQA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Igsf3Q6ZQA6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Igsf3Q6ZQA6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Igsf3Q6ZQA6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Igsf3Q6ZQA6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Igsf3Q6ZQA6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Igsf3Q6ZQA6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igsf3Q6ZQA6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igsf3Q6ZQA6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Igsf3Q6ZQA6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igsf3Q6ZQA6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Igsf3Q6ZQA6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igsf3Q6ZQA6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igsf3Q6ZQA6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igsf3Q6ZQA6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igsf3Q6ZQA6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igsf3Q6ZQA6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igsf3Q6ZQA6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igsf3Q6ZQA6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Igsf3Q6ZQA6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms