Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
March6Q6ZQ89 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
March6Q6ZQ89 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
March6Q6ZQ89 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
March6Q6ZQ89 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
March6Q6ZQ89 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
March6Q6ZQ89 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
March6Q6ZQ89 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
March6Q6ZQ89 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
March6Q6ZQ89 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
March6Q6ZQ89 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
March6Q6ZQ89 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
March6Q6ZQ89 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
March6Q6ZQ89 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
March6Q6ZQ89 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
March6Q6ZQ89 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
March6Q6ZQ89 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
March6Q6ZQ89 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
March6Q6ZQ89 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
March6Q6ZQ89 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
March6Q6ZQ89 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
March6Q6ZQ89 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
March6Q6ZQ89 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
March6Q6ZQ89 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
March6Q6ZQ89 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
March6Q6ZQ89 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
March6Q6ZQ89 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
March6Q6ZQ89 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
March6Q6ZQ89 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
March6Q6ZQ89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
March6Q6ZQ89 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
March6Q6ZQ89 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
March6Q6ZQ89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
March6Q6ZQ89 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
March6Q6ZQ89 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
March6Q6ZQ89 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
March6Q6ZQ89 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
March6Q6ZQ89 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
March6Q6ZQ89 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
March6Q6ZQ89 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
March6Q6ZQ89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
March6Q6ZQ89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
March6Q6ZQ89 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
March6Q6ZQ89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
March6Q6ZQ89 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
March6Q6ZQ89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms