Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ssxb5Q6XAS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ssxb5Q6XAS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssxb5Q6XAS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssxb5Q6XAS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ssxb5Q6XAS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssxb5Q6XAS2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssxb5Q6XAS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssxb5Q6XAS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssxb5Q6XAS2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb5Q6XAS2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb5Q6XAS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb5Q6XAS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssxb5Q6XAS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssxb5Q6XAS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssxb5Q6XAS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssxb5Q6XAS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssxb5Q6XAS2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssxb5Q6XAS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssxb5Q6XAS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssxb5Q6XAS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssxb5Q6XAS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ssxb5Q6XAS2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb5Q6XAS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb5Q6XAS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms