Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip1Q6QD59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip1Q6QD59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip1Q6QD59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip1Q6QD59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip1Q6QD59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip1Q6QD59 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip1Q6QD59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip1Q6QD59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip1Q6QD59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip1Q6QD59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bnip1Q6QD59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip1Q6QD59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnip1Q6QD59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnip1Q6QD59 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip1Q6QD59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip1Q6QD59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bnip1Q6QD59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnip1Q6QD59 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bnip1Q6QD59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bnip1Q6QD59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bnip1Q6QD59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bnip1Q6QD59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bnip1Q6QD59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bnip1Q6QD59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bnip1Q6QD59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bnip1Q6QD59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bnip1Q6QD59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bnip1Q6QD59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bnip1Q6QD59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnip1Q6QD59 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnip1Q6QD59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnip1Q6QD59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnip1Q6QD59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip1Q6QD59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip1Q6QD59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip1Q6QD59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip1Q6QD59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bnip1Q6QD59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bnip1Q6QD59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms