Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnip4Q6PHZ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnip4Q6PHZ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnip4Q6PHZ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnip4Q6PHZ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnip4Q6PHZ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip4Q6PHZ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnip4Q6PHZ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip4Q6PHZ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcnip4Q6PHZ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcnip4Q6PHZ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcnip4Q6PHZ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcnip4Q6PHZ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcnip4Q6PHZ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms