Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim45Q6PFY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim45Q6PFY8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim45Q6PFY8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim45Q6PFY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim45Q6PFY8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim45Q6PFY8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim45Q6PFY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim45Q6PFY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim45Q6PFY8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim45Q6PFY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim45Q6PFY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim45Q6PFY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim45Q6PFY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim45Q6PFY8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim45Q6PFY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim45Q6PFY8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim45Q6PFY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim45Q6PFY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim45Q6PFY8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim45Q6PFY8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim45Q6PFY8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim45Q6PFY8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim45Q6PFY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim45Q6PFY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim45Q6PFY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim45Q6PFY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim45Q6PFY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim45Q6PFY8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim45Q6PFY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim45Q6PFY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim45Q6PFY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim45Q6PFY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms