Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE84

Stoml3, Stomatin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stoml3Q6PE84 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stoml3Q6PE84 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stoml3Q6PE84 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stoml3Q6PE84 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stoml3Q6PE84 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stoml3Q6PE84 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stoml3Q6PE84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stoml3Q6PE84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Stoml3Q6PE84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stoml3Q6PE84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stoml3Q6PE84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stoml3Q6PE84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms