Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dhx40Q6PE54 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dhx40Q6PE54 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dhx40Q6PE54 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dhx40Q6PE54 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dhx40Q6PE54 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dhx40Q6PE54 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dhx40Q6PE54 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dhx40Q6PE54 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dhx40Q6PE54 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Dhx40Q6PE54 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dhx40Q6PE54 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dhx40Q6PE54 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dhx40Q6PE54 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dhx40Q6PE54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dhx40Q6PE54 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dhx40Q6PE54 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dhx40Q6PE54 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dhx40Q6PE54 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dhx40Q6PE54 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dhx40Q6PE54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dhx40Q6PE54 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dhx40Q6PE54 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dhx40Q6PE54 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dhx40Q6PE54 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dhx40Q6PE54 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Dhx40Q6PE54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dhx40Q6PE54 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dhx40Q6PE54 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dhx40Q6PE54 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dhx40Q6PE54 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dhx40Q6PE54 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dhx40Q6PE54 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dhx40Q6PE54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dhx40Q6PE54 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dhx40Q6PE54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dhx40Q6PE54 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Dhx40Q6PE54 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dhx40Q6PE54 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dhx40Q6PE54 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dhx40Q6PE54 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dhx40Q6PE54 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dhx40Q6PE54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dhx40Q6PE54 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dhx40Q6PE54 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx40Q6PE54 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Dhx40Q6PE54 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dhx40Q6PE54 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms