Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bhlhb9Q6PB60 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhb9Q6PB60 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhb9Q6PB60 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhb9Q6PB60 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhb9Q6PB60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bhlhb9Q6PB60 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bhlhb9Q6PB60 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bhlhb9Q6PB60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bhlhb9Q6PB60 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bhlhb9Q6PB60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bhlhb9Q6PB60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlhb9Q6PB60 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bhlhb9Q6PB60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bhlhb9Q6PB60 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bhlhb9Q6PB60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bhlhb9Q6PB60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bhlhb9Q6PB60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bhlhb9Q6PB60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlhb9Q6PB60 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlhb9Q6PB60 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bhlhb9Q6PB60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bhlhb9Q6PB60 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bhlhb9Q6PB60 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bhlhb9Q6PB60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bhlhb9Q6PB60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlhb9Q6PB60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhb9Q6PB60 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlhb9Q6PB60 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bhlhb9Q6PB60 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bhlhb9Q6PB60 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bhlhb9Q6PB60 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhb9Q6PB60 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms