Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fhod1Q6P9Q4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fhod1Q6P9Q4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fhod1Q6P9Q4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fhod1Q6P9Q4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fhod1Q6P9Q4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fhod1Q6P9Q4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fhod1Q6P9Q4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fhod1Q6P9Q4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fhod1Q6P9Q4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fhod1Q6P9Q4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fhod1Q6P9Q4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fhod1Q6P9Q4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fhod1Q6P9Q4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fhod1Q6P9Q4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fhod1Q6P9Q4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fhod1Q6P9Q4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fhod1Q6P9Q4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms