Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC061212Q6P8K3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC061212Q6P8K3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BC061212Q6P8K3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC061212Q6P8K3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC061212Q6P8K3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC061212Q6P8K3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC061212Q6P8K3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BC061212Q6P8K3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC061212Q6P8K3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC061212Q6P8K3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC061212Q6P8K3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC061212Q6P8K3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC061212Q6P8K3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC061212Q6P8K3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC061212Q6P8K3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC061212Q6P8K3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC061212Q6P8K3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC061212Q6P8K3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms