Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrp12Q6P5B0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrp12Q6P5B0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rrp12Q6P5B0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrp12Q6P5B0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrp12Q6P5B0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrp12Q6P5B0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rrp12Q6P5B0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rrp12Q6P5B0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrp12Q6P5B0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrp12Q6P5B0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrp12Q6P5B0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrp12Q6P5B0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrp12Q6P5B0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrp12Q6P5B0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Rrp12Q6P5B0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rrp12Q6P5B0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rrp12Q6P5B0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrp12Q6P5B0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrp12Q6P5B0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrp12Q6P5B0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrp12Q6P5B0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrp12Q6P5B0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrp12Q6P5B0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrp12Q6P5B0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrp12Q6P5B0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrp12Q6P5B0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rrp12Q6P5B0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rrp12Q6P5B0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rrp12Q6P5B0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rrp12Q6P5B0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rrp12Q6P5B0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rrp12Q6P5B0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rrp12Q6P5B0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rrp12Q6P5B0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrp12Q6P5B0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rrp12Q6P5B0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrp12Q6P5B0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms