Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Rprd2Q6NXI6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rprd2Q6NXI6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Rprd2Q6NXI6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rprd2Q6NXI6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rprd2Q6NXI6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rprd2Q6NXI6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rprd2Q6NXI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rprd2Q6NXI6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rprd2Q6NXI6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rprd2Q6NXI6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rprd2Q6NXI6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Rprd2Q6NXI6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rprd2Q6NXI6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rprd2Q6NXI6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rprd2Q6NXI6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rprd2Q6NXI6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rprd2Q6NXI6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rprd2Q6NXI6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rprd2Q6NXI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rprd2Q6NXI6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rprd2Q6NXI6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rprd2Q6NXI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rprd2Q6NXI6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rprd2Q6NXI6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rprd2Q6NXI6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Rprd2Q6NXI6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rprd2Q6NXI6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rprd2Q6NXI6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rprd2Q6NXI6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rprd2Q6NXI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rprd2Q6NXI6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Rprd2Q6NXI6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rprd2Q6NXI6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rprd2Q6NXI6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rprd2Q6NXI6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rprd2Q6NXI6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rprd2Q6NXI6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rprd2Q6NXI6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rprd2Q6NXI6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Rprd2Q6NXI6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rprd2Q6NXI6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rprd2Q6NXI6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rprd2Q6NXI6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Rprd2Q6NXI6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rprd2Q6NXI6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rprd2Q6NXI6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rprd2Q6NXI6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rprd2Q6NXI6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Rprd2Q6NXI6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rprd2Q6NXI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rprd2Q6NXI6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rprd2Q6NXI6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rprd2Q6NXI6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rprd2Q6NXI6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms