Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2810408A11RikQ6NSU2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2810408A11RikQ6NSU2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2810408A11RikQ6NSU2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2810408A11RikQ6NSU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2810408A11RikQ6NSU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2810408A11RikQ6NSU2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2810408A11RikQ6NSU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2810408A11RikQ6NSU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
2810408A11RikQ6NSU2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms