Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ggnbp1Q6K1E7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ggnbp1Q6K1E7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ggnbp1Q6K1E7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ggnbp1Q6K1E7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ggnbp1Q6K1E7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ggnbp1Q6K1E7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ggnbp1Q6K1E7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ggnbp1Q6K1E7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ggnbp1Q6K1E7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ggnbp1Q6K1E7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ggnbp1Q6K1E7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ggnbp1Q6K1E7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ggnbp1Q6K1E7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ggnbp1Q6K1E7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ggnbp1Q6K1E7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ggnbp1Q6K1E7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ggnbp1Q6K1E7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ggnbp1Q6K1E7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ggnbp1Q6K1E7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ggnbp1Q6K1E7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ggnbp1Q6K1E7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ggnbp1Q6K1E7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ggnbp1Q6K1E7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ggnbp1Q6K1E7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ggnbp1Q6K1E7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ggnbp1Q6K1E7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ggnbp1Q6K1E7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ggnbp1Q6K1E7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms