Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt72Q6IME9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt72Q6IME9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt72Q6IME9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt72Q6IME9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt72Q6IME9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt72Q6IME9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt72Q6IME9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt72Q6IME9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt72Q6IME9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt72Q6IME9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt72Q6IME9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt72Q6IME9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt72Q6IME9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt72Q6IME9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt72Q6IME9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt72Q6IME9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt72Q6IME9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt72Q6IME9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt72Q6IME9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt72Q6IME9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms