Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn2Q68FG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptbn2Q68FG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptbn2Q68FG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn2Q68FG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptbn2Q68FG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptbn2Q68FG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptbn2Q68FG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn2Q68FG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptbn2Q68FG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn2Q68FG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptbn2Q68FG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptbn2Q68FG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn2Q68FG2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn2Q68FG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn2Q68FG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn2Q68FG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn2Q68FG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn2Q68FG2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn2Q68FG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn2Q68FG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn2Q68FG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn2Q68FG2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sptbn2Q68FG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn2Q68FG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn2Q68FG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn2Q68FG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn2Q68FG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sptbn2Q68FG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sptbn2Q68FG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sptbn2Q68FG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sptbn2Q68FG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sptbn2Q68FG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn2Q68FG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sptbn2Q68FG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn2Q68FG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn2Q68FG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn2Q68FG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn2Q68FG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sptbn2Q68FG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptbn2Q68FG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn2Q68FG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn2Q68FG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptbn2Q68FG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn2Q68FG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptbn2Q68FG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptbn2Q68FG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn2Q68FG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptbn2Q68FG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn2Q68FG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptbn2Q68FG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms