Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q66JV7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q66JV7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Q66JV7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Q66JV7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q66JV7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q66JV7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q66JV7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q66JV7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q66JV7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q66JV7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q66JV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Q66JV7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Q66JV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q66JV7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q66JV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Q66JV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q66JV7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q66JV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q66JV7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q66JV7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q66JV7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q66JV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q66JV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q66JV7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q66JV7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q66JV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Q66JV7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q66JV7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q66JV7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q66JV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q66JV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q66JV7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q66JV7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q66JV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q66JV7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q66JV7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q66JV7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q66JV7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q66JV7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q66JV7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q66JV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q66JV7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q66JV7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q66JV7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q66JV7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q66JV7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q66JV7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q66JV7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q66JV7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q66JV7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q66JV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q66JV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q66JV7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q66JV7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q66JV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q66JV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q66JV7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q66JV7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q66JV7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q66JV7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q66JV7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Q66JV7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q66JV7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Q66JV7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q66JV7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q66JV7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Q66JV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q66JV7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Q66JV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Q66JV7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q66JV7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q66JV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q66JV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Q66JV7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q66JV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q66JV7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q66JV7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q66JV7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q66JV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q66JV7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q66JV7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q66JV7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Q66JV7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q66JV7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q66JV7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q66JV7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q66JV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q66JV7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q66JV7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q66JV7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q66JV7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q66JV7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q66JV7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q66JV7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q66JV7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q66JV7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q66JV7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q66JV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q66JV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms