Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stx3Q64704 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx3Q64704 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx3Q64704 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx3Q64704 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx3Q64704 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx3Q64704 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx3Q64704 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx3Q64704 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx3Q64704 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx3Q64704 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx3Q64704 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx3Q64704 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx3Q64704 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx3Q64704 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx3Q64704 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx3Q64704 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx3Q64704 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx3Q64704 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx3Q64704 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx3Q64704 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx3Q64704 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx3Q64704 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx3Q64704 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx3Q64704 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx3Q64704 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx3Q64704 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx3Q64704 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx3Q64704 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms