Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn13Q64512 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn13Q64512 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn13Q64512 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn13Q64512 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn13Q64512 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn13Q64512 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn13Q64512 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn13Q64512 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn13Q64512 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn13Q64512 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn13Q64512 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn13Q64512 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn13Q64512 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn13Q64512 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn13Q64512 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn13Q64512 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn13Q64512 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn13Q64512 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn13Q64512 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn13Q64512 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn13Q64512 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn13Q64512 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn13Q64512 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn13Q64512 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn13Q64512 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn13Q64512 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn13Q64512 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn13Q64512 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn13Q64512 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn13Q64512 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn13Q64512 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn13Q64512 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn13Q64512 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn13Q64512 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn13Q64512 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn13Q64512 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn13Q64512 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn13Q64512 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn13Q64512 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn13Q64512 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn13Q64512 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn13Q64512 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn13Q64512 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn13Q64512 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn13Q64512 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn13Q64512 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpn13Q64512 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn13Q64512 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn13Q64512 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn13Q64512 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn13Q64512 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn13Q64512 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn13Q64512 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn13Q64512 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn13Q64512 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms