Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf1Q64213 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf1Q64213 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sf1Q64213 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf1Q64213 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf1Q64213 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf1Q64213 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf1Q64213 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf1Q64213 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf1Q64213 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf1Q64213 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf1Q64213 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf1Q64213 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf1Q64213 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf1Q64213 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf1Q64213 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf1Q64213 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf1Q64213 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf1Q64213 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf1Q64213 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf1Q64213 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sf1Q64213 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf1Q64213 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf1Q64213 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf1Q64213 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf1Q64213 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf1Q64213 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf1Q64213 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf1Q64213 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf1Q64213 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf1Q64213 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf1Q64213 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf1Q64213 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf1Q64213 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf1Q64213 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf1Q64213 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf1Q64213 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf1Q64213 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf1Q64213 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf1Q64213 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms