Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr2kQ63871 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2kQ63871 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr2kQ63871 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr2kQ63871 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2kQ63871 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2kQ63871 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2kQ63871 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2kQ63871 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr2kQ63871 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2kQ63871 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr2kQ63871 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2kQ63871 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr2kQ63871 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2kQ63871 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2kQ63871 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2kQ63871 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2kQ63871 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr2kQ63871 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2kQ63871 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms