Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf260Q62513 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf260Q62513 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf260Q62513 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf260Q62513 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf260Q62513 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf260Q62513 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf260Q62513 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf260Q62513 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf260Q62513 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf260Q62513 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf260Q62513 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf260Q62513 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf260Q62513 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Znf260Q62513 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znf260Q62513 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf260Q62513 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf260Q62513 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf260Q62513 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf260Q62513 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf260Q62513 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf260Q62513 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf260Q62513 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf260Q62513 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf260Q62513 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf260Q62513 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf260Q62513 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf260Q62513 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf260Q62513 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf260Q62513 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf260Q62513 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf260Q62513 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf260Q62513 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf260Q62513 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf260Q62513 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms