Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn4Q62472 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn4Q62472 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn4Q62472 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn4Q62472 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn4Q62472 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn4Q62472 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn4Q62472 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn4Q62472 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn4Q62472 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn4Q62472 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcn4Q62472 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lcn4Q62472 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcn4Q62472 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcn4Q62472 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcn4Q62472 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcn4Q62472 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcn4Q62472 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn4Q62472 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lcn4Q62472 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lcn4Q62472 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms