Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp1Q62442 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp1Q62442 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp1Q62442 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp1Q62442 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp1Q62442 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp1Q62442 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp1Q62442 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp1Q62442 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp1Q62442 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp1Q62442 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp1Q62442 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms