Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SpegQ62407 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpegQ62407 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SpegQ62407 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SpegQ62407 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SpegQ62407 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpegQ62407 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SpegQ62407 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SpegQ62407 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpegQ62407 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SpegQ62407 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SpegQ62407 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SpegQ62407 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SpegQ62407 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SpegQ62407 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SpegQ62407 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpegQ62407 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpegQ62407 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SpegQ62407 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SpegQ62407 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SpegQ62407 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SpegQ62407 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SpegQ62407 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SpegQ62407 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SpegQ62407 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SpegQ62407 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SpegQ62407 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SpegQ62407 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SpegQ62407 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SpegQ62407 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SpegQ62407 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SpegQ62407 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SpegQ62407 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SpegQ62407 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SpegQ62407 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SpegQ62407 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SpegQ62407 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SpegQ62407 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SpegQ62407 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SpegQ62407 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SpegQ62407 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SpegQ62407 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SpegQ62407 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SpegQ62407 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SpegQ62407 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SpegQ62407 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SpegQ62407 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SpegQ62407 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SpegQ62407 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SpegQ62407 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SpegQ62407 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SpegQ62407 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SpegQ62407 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SpegQ62407 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SpegQ62407 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SpegQ62407 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SpegQ62407 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SpegQ62407 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SpegQ62407 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SpegQ62407 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SpegQ62407 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SpegQ62407 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SpegQ62407 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SpegQ62407 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SpegQ62407 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SpegQ62407 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SpegQ62407 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SpegQ62407 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SpegQ62407 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SpegQ62407 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SpegQ62407 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SpegQ62407 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SpegQ62407 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SpegQ62407 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SpegQ62407 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpegQ62407 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpegQ62407 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SpegQ62407 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SpegQ62407 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SpegQ62407 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SpegQ62407 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SpegQ62407 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SpegQ62407 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SpegQ62407 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SpegQ62407 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SpegQ62407 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SpegQ62407 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms