Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3a2Q62203 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3a2Q62203 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3a2Q62203 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a2Q62203 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a2Q62203 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a2Q62203 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a2Q62203 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3a2Q62203 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a2Q62203 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a2Q62203 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms