Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema4aQ62178 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4aQ62178 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema4aQ62178 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema4aQ62178 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4aQ62178 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4aQ62178 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema4aQ62178 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4aQ62178 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema4aQ62178 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema4aQ62178 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4aQ62178 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema4aQ62178 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sema4aQ62178 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4aQ62178 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema4aQ62178 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4aQ62178 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4aQ62178 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema4aQ62178 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4aQ62178 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms