Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt33bQ61897 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt33bQ61897 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt33bQ61897 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt33bQ61897 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt33bQ61897 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt33bQ61897 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt33bQ61897 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt33bQ61897 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt33bQ61897 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt33bQ61897 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt33bQ61897 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt33bQ61897 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt33bQ61897 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt33bQ61897 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt33bQ61897 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt33bQ61897 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt33bQ61897 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt33bQ61897 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt33bQ61897 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt33bQ61897 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt33bQ61897 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt33bQ61897 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms