Protein–RNA interactions for Protein: Q61806

Xlr3c, X-linked lymphocyte-regulated protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3cQ61806 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xlr3cQ61806 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xlr3cQ61806 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xlr3cQ61806 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xlr3cQ61806 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xlr3cQ61806 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xlr3cQ61806 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xlr3cQ61806 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xlr3cQ61806 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xlr3cQ61806 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xlr3cQ61806 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xlr3cQ61806 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xlr3cQ61806 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Xlr3cQ61806 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xlr3cQ61806 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xlr3cQ61806 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xlr3cQ61806 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xlr3cQ61806 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xlr3cQ61806 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xlr3cQ61806 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xlr3cQ61806 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xlr3cQ61806 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xlr3cQ61806 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xlr3cQ61806 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xlr3cQ61806 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xlr3cQ61806 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 881 ms