Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itm2aQ61500 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2aQ61500 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2aQ61500 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Itm2aQ61500 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itm2aQ61500 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itm2aQ61500 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2aQ61500 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itm2aQ61500 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itm2aQ61500 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2aQ61500 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2aQ61500 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2aQ61500 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itm2aQ61500 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2aQ61500 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itm2aQ61500 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itm2aQ61500 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itm2aQ61500 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itm2aQ61500 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itm2aQ61500 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2aQ61500 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2aQ61500 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2aQ61500 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2aQ61500 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itm2aQ61500 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itm2aQ61500 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms