Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcolceQ61398 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PcolceQ61398 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcolceQ61398 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PcolceQ61398 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PcolceQ61398 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PcolceQ61398 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PcolceQ61398 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PcolceQ61398 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PcolceQ61398 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcolceQ61398 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PcolceQ61398 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PcolceQ61398 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PcolceQ61398 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcolceQ61398 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcolceQ61398 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PcolceQ61398 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PcolceQ61398 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcolceQ61398 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcolceQ61398 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcolceQ61398 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcolceQ61398 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcolceQ61398 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcolceQ61398 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PcolceQ61398 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcolceQ61398 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcolceQ61398 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcolceQ61398 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcolceQ61398 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcolceQ61398 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PcolceQ61398 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcolceQ61398 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PcolceQ61398 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PcolceQ61398 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PcolceQ61398 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PcolceQ61398 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PcolceQ61398 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcolceQ61398 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcolceQ61398 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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