Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gata6Q61169 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gata6Q61169 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gata6Q61169 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gata6Q61169 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gata6Q61169 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gata6Q61169 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gata6Q61169 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gata6Q61169 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gata6Q61169 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gata6Q61169 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gata6Q61169 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gata6Q61169 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gata6Q61169 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gata6Q61169 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gata6Q61169 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gata6Q61169 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gata6Q61169 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gata6Q61169 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gata6Q61169 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gata6Q61169 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gata6Q61169 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gata6Q61169 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gata6Q61169 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gata6Q61169 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gata6Q61169 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gata6Q61169 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gata6Q61169 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gata6Q61169 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gata6Q61169 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gata6Q61169 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gata6Q61169 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gata6Q61169 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gata6Q61169 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gata6Q61169 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms