Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gbp4Q61107 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gbp4Q61107 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gbp4Q61107 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gbp4Q61107 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gbp4Q61107 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gbp4Q61107 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gbp4Q61107 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gbp4Q61107 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gbp4Q61107 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gbp4Q61107 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gbp4Q61107 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gbp4Q61107 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gbp4Q61107 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp4Q61107 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gbp4Q61107 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gbp4Q61107 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp4Q61107 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp4Q61107 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp4Q61107 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gbp4Q61107 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gbp4Q61107 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gbp4Q61107 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gbp4Q61107 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gbp4Q61107 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gbp4Q61107 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gbp4Q61107 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbp4Q61107 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbp4Q61107 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gbp4Q61107 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gbp4Q61107 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gbp4Q61107 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gbp4Q61107 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp4Q61107 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp4Q61107 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gbp4Q61107 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms