Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamb3Q61087 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamb3Q61087 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamb3Q61087 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamb3Q61087 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamb3Q61087 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamb3Q61087 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamb3Q61087 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamb3Q61087 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamb3Q61087 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamb3Q61087 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamb3Q61087 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamb3Q61087 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamb3Q61087 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lamb3Q61087 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamb3Q61087 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamb3Q61087 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamb3Q61087 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamb3Q61087 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lamb3Q61087 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamb3Q61087 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lamb3Q61087 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamb3Q61087 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamb3Q61087 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamb3Q61087 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamb3Q61087 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamb3Q61087 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamb3Q61087 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamb3Q61087 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms