Protein–RNA interactions for Protein: Q60967

Papss1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papss1Q60967 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Papss1Q60967 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Papss1Q60967 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Papss1Q60967 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Papss1Q60967 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Papss1Q60967 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Papss1Q60967 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Papss1Q60967 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Papss1Q60967 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Papss1Q60967 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Papss1Q60967 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Papss1Q60967 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Papss1Q60967 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Papss1Q60967 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Papss1Q60967 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Papss1Q60967 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Papss1Q60967 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Papss1Q60967 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Papss1Q60967 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Papss1Q60967 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Papss1Q60967 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Papss1Q60967 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Papss1Q60967 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Papss1Q60967 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Papss1Q60967 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Papss1Q60967 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Papss1Q60967 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Papss1Q60967 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Papss1Q60967 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms