Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mkrn3Q60764 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mkrn3Q60764 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mkrn3Q60764 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mkrn3Q60764 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mkrn3Q60764 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mkrn3Q60764 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mkrn3Q60764 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mkrn3Q60764 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mkrn3Q60764 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mkrn3Q60764 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mkrn3Q60764 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mkrn3Q60764 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mkrn3Q60764 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mkrn3Q60764 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mkrn3Q60764 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mkrn3Q60764 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mkrn3Q60764 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Mkrn3Q60764 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mkrn3Q60764 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mkrn3Q60764 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mkrn3Q60764 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mkrn3Q60764 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mkrn3Q60764 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mkrn3Q60764 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mkrn3Q60764 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mkrn3Q60764 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Mkrn3Q60764 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mkrn3Q60764 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mkrn3Q60764 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mkrn3Q60764 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mkrn3Q60764 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mkrn3Q60764 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mkrn3Q60764 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mkrn3Q60764 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mkrn3Q60764 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mkrn3Q60764 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mkrn3Q60764 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mkrn3Q60764 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mkrn3Q60764 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mkrn3Q60764 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mkrn3Q60764 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mkrn3Q60764 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mkrn3Q60764 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms