Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pabpn1lQ5XFR0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pabpn1lQ5XFR0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpn1lQ5XFR0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pabpn1lQ5XFR0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pabpn1lQ5XFR0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pabpn1lQ5XFR0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpn1lQ5XFR0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pabpn1lQ5XFR0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pabpn1lQ5XFR0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pabpn1lQ5XFR0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pabpn1lQ5XFR0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpn1lQ5XFR0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpn1lQ5XFR0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpn1lQ5XFR0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1lQ5XFR0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1lQ5XFR0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpn1lQ5XFR0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpn1lQ5XFR0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms