Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkaplQ5SZT7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NkaplQ5SZT7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkaplQ5SZT7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NkaplQ5SZT7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkaplQ5SZT7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkaplQ5SZT7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkaplQ5SZT7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkaplQ5SZT7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkaplQ5SZT7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NkaplQ5SZT7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkaplQ5SZT7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkaplQ5SZT7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkaplQ5SZT7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkaplQ5SZT7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NkaplQ5SZT7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkaplQ5SZT7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NkaplQ5SZT7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkaplQ5SZT7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkaplQ5SZT7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkaplQ5SZT7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkaplQ5SZT7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NkaplQ5SZT7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkaplQ5SZT7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
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