Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1dQ5SYD0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1dQ5SYD0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1dQ5SYD0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1dQ5SYD0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1dQ5SYD0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1dQ5SYD0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1dQ5SYD0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1dQ5SYD0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1dQ5SYD0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1dQ5SYD0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1dQ5SYD0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1dQ5SYD0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo1dQ5SYD0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Myo1dQ5SYD0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo1dQ5SYD0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo1dQ5SYD0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo1dQ5SYD0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo1dQ5SYD0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo1dQ5SYD0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo1dQ5SYD0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo1dQ5SYD0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo1dQ5SYD0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myo1dQ5SYD0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myo1dQ5SYD0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo1dQ5SYD0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myo1dQ5SYD0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myo1dQ5SYD0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo1dQ5SYD0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo1dQ5SYD0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo1dQ5SYD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo1dQ5SYD0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1dQ5SYD0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo1dQ5SYD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms